Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa2P31245 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa2P31245 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms