Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms