Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd8P29595 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms