Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Casp1P29452 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Casp1P29452 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Casp1P29452 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms