Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HexaP29416 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HexaP29416 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HexaP29416 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HexaP29416 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HexaP29416 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HexaP29416 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HexaP29416 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HexaP29416 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HexaP29416 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HexaP29416 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HexaP29416 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HexaP29416 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms