Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sept4P28661 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sept4P28661 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms