Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BgnP28653 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BgnP28653 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BgnP28653 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BgnP28653 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BgnP28653 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BgnP28653 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BgnP28653 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BgnP28653 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BgnP28653 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms