Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb3P28231 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms