Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb9P28076 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb9P28076 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms