Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vav1P27870 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vav1P27870 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms