Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3P27659 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl3P27659 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms