Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U2af2P26369 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U2af2P26369 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms