Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChgaP26339 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ChgaP26339 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms