Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou2f1P25425 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms