Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZfaP23607 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZfaP23607 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms