Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ggta1P23336 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ggta1P23336 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ggta1P23336 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ggta1P23336 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms