Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnnc2P20801 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms