Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou5f1P20263 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou5f1P20263 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms