Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfaP20033 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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