Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a1P19437 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a1P19437 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms