Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NefhP19246 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NefhP19246 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NefhP19246 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NefhP19246 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NefhP19246 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NefhP19246 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms