Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms