Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms