Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb3P17125 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb3P17125 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms