Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms