Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb1P12658 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb1P12658 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms