Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Chrm1P12657 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms