Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DmdP11531 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DmdP11531 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DmdP11531 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DmdP11531 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DmdP11531 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DmdP11531 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DmdP11531 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DmdP11531 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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DmdP11531 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DmdP11531 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DmdP11531 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DmdP11531 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DmdP11531 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms