Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Myod1P10085 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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