Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Becn2P0DM65 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Becn2P0DM65 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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