Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf2P09926 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Surf2P09926 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Surf2P09926 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf2P09926 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf2P09926 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Surf2P09926 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms