Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc8P09025 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms