Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa5P09021 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms