Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spta1P08032 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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