Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtrP07309 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtrP07309 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms