Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-Eb1P04230 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-Eb1P04230 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms