Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04213 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04213 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04213 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04213 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04213 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04213 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms