Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P03987 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P03987 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P03987 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P03987 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P03987 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P03987 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P03987 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P03987 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P03987 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P03987 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P03987 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms