Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01852 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01852 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01852 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01852 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01852 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01852 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01852 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01852 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01852 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01852 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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