Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01735 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01735 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01735 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01735 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01735 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms