Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lancl1O89112 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lancl1O89112 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms