Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Casp8O89110 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms