Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnkO88874 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnkO88874 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms