Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn3O88705 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms