Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nme6O88425 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme6O88425 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme6O88425 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme6O88425 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme6O88425 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms