Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaskO70589 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CaskO70589 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CaskO70589 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CaskO70589 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CaskO70589 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CaskO70589 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CaskO70589 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CaskO70589 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CaskO70589 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms