Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Foxq1O70220 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxq1O70220 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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