Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms