Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms