Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms